Судалгаа, инновацын байнгын хороо нь боловсролын салбарт шинжлэх ухаанд суурилсан судалгаа, шинэчлэлийг дэмжихэд чиглэнэ. Эрдэм шинжилгээний ажил, судалгааны төслүүдийг зохион байгуулах, дэмжих, үнэлэх чиг үүрэгтэй. Мөн инновац, шилдэг туршлагыг нэвтрүүлэх, түгээн дэлгэрүүлэхэд анхаарна. Энэхүү хороо нь бодлого, шийдвэрийг нотолгоонд суурилуулахад чухал хувь нэмэр оруулна.